1. Обнаружение потока прибора
Первое, что нужно учитывать, это то, как часто в лаборатории необходимо использовать количественный ПЦР-инструмент. Дэвид Гинзингер, руководитель отдела анализа генома в Калифорнийском университете, онкологический центр Сан-Франциско, протестировал большинство количественных ПЦР-аппаратов на рынке. Он сказал, что, если он не используется в больших масштабах, например, он в основном используется для тестирования известных генов, то он не нуждается в дорогих продуктах высокого класса. Но для тех лабораторий, которым необходимо найти новые лекарственные мишени и маркеры болезней, им нужны инструменты, которые могут держать 384-луночные планшеты и работать быстрее. Однако только такой высокопроизводительный инструмент недостаточно быстр, и вы обнаружите, что пробоподготовка становится узким местом для ограничения скорости. Поэтому для лабораторий с высокой пропускной способностью часто требуются дополнительные автоматизированные инструменты. Пока кнопка нажата, прибор автоматически обрабатывает образцы, очищает нуклеиновые кислоты и готовит шаблоны ПЦР.
2. Возможность многократного усиления
Многократное усиление становится все жарче. Количественное оборудование для ПЦР в режиме реального времени не является иммунитетом. Высококачественный инструмент количественной ПЦР имеет несколько каналов детектирования, поэтому он может обнаруживать процесс амплификации нескольких шаблонов в одной пробирке. Новый LightCycler2.0 имеет 6 каналов обнаружения, на 3 больше, чем оригинал. SmartCyclerⅡ имеет 4 канала обнаружения. Stratagene, который славится своими библиотечными продуктами, также имеет количественный ПЦР-прибор Mx3000P с менее чем половиной цены на Roche и хорошую репутацию, то есть 4 канала обнаружения. Однако многократное усиление не подходит для всех, потому что это усложняет эксперимент.
3. Программное обеспечение
Когда вы будете готовы выбрать количественный ПЦР-инструмент, вы должны проверить прилагаемое программное обеспечение. Удобно ли использовать, можете ли вы провести необходимый анализ, есть несколько форматов вывода. Однако вам следует обратить внимание на то, является ли слишком простое в использовании программное обеспечение относительно простым по своей функции и не может выполнять сложные вычисления. Предыдущее программное обеспечение требует от вас дальнейшего анализа. Новое программное обеспечение уже может обрабатывать все. В дополнение к базовым функциям, некоторые программы могут также иметь больше функций, таких как проектирование праймеров и зондов, проектирование множественного анализа, коррекция фона, нормализация данных и так далее. Виллиан Демьян, руководитель отдела прикладных и технических услуг департамента прикладных наук компании Roche, подчеркнул, что количественная ПЦР - это процесс геометрической амплификации: вначале существует разница в копировании, а результаты варьируются в зависимости от геометрического порядка.
4. Гибкость
Крупномасштабное загруженное лабораторное оборудование, безусловно, завидно, и обычные лаборатории также могут иметь прекрасный выбор. Нынешние поставщики имеют много технических экспертов, которые не только понимают ваши текущие потребности, но и очень продуманно учитывают возможные будущие изменения спроса, такие как предоставление разнообразных обновляемых аксессуаров и модулей. MyCycler от BioRad может выбирать модули и обновлять их в реальном времени. Количественный ПЦР-инструмент ABI имеет множество различных пробоотборников, которые могут преобразовывать 96-луночные резервуары в двойные 384-луночные резервуары для удовлетворения некоторых требований высокой производительности. Для лабораторий, которые только что начали делать КПЦР в небольших количествах, хорошим выбором является количественный ПЦР-прибор SmartCycler II: базовый модуль имеет 16 независимых пробирок для контроля температуры и 16 совершенно независимых различных экспериментов, которые можно проводить одновременно или до, и после. «Доступ»: когда лаборатории требуется крупномасштабный эксперимент, ее можно очень экономично модернизировать с 1 до 6 базовых модулей, что составляет 96 пробоотборных скважин. Хотя 96-луночные планшеты нельзя использовать, когда ученик начинает небольшое количество экспериментов, другие также могут подключаться в любое время, чтобы начать свои собственные независимые эксперименты, и они не мешают друг другу, что увеличивает гибкость. Это очень гибкий вариант для лабораторий, которые проводят небольшое количество экспериментов и имеют ограниченный бюджет в начале.
5. Неопределенность
Хотя программное обеспечение может быть частично исправлено, лучше купить инструмент с менее систематическими ошибками, не требуя так много корректировок вычислений, чем путем расчетов. Синцингер считает, что особое внимание следует уделять различиям между пробоотборными лунками прибора. Помимо хорошо известных разностей температур между отверстиями для образцов, имеются также небольшие различия в расстоянии оптического пути между отверстием для образцов и детектором, небольшая разница в длине волокна, отвечающего за передачу, прием и передачу сигналов, небольшая разница в расстоянии и угле между линзой и отверстием для образцов и даже Влияние ячейки образца на передачу сигнала. Cinzinger провел такой же тест на большинстве имеющихся в продаже количественных ПЦР-инструментов и амплифицировал те же самые образцы и реагенты в режиме реального времени в каждой лунке прибора. К сожалению, много раз, будут разные результаты в разных скважинах.
6. Подбор комплектов
Хотя торговый персонал будет гордиться отличными наборами контроля качества, а решения будут получать результаты один на один, но покупка готовых комплектов не является решением различий. Серьезные оценочные эксперименты и аналитические эксперименты являются решениями.
